Первый отдел
- Отдел договорной работы и учета недвижимого имущества
Финансово-экономическое управление
- Отдел нормирования и оплаты труда
- Отдел бюджетного планирования и финансового обеспечения
- Контрактная служба
- Отдел доходов
- Отдел бухгалтерского учета, отчетности и мониторингов
- Отдел учета НФА
- Отдел расчетов по заработной плате и стипендии
Управление стандартизации и качества
Управление правовой работы и внутреннего аудита
- Отдел правовой работы
- Отдел внутреннего аудита
Управление делами и кадровой политики
Управление международной деятельности
- Международный отдел
- Отдел рекламно-выставочной деятельности
- Отдел "Офис иностранных студентов"
- Центр русского языка "Подготовительное отделение"
Управление по информационным технологиям
- Отдел WEB-разработки и сопровождения программного обеспечения
- Отдел системного администрирования
- Отдел мультимедийных технологий
Учебно-методическое управление
- Сектор статистики и итоговой аттестации
- Сектор расчета и учета учебной работы
- Диспетчерская служба
- Отдел лицензирования и аккредитации
- Отдел образовательных программ
- Отдел региональных подразделений и СПО
- Отдел комплектования и каталогизации фондов
- Отдел основного хранения фондов
- Отдел учебной литературы
- Отдел научной литературы
- Отдел методического и технического сопровождения
Центр компетенций и сертификационного тестирования
Центр по формированию контингента студентов
Управление воспитательной работы
- Отдел поддержки молодежных инициатив
- Центр координации воспитательной деятельности
- Служба по связям с общественностью
- Студенческий клуб
Управление социальной политики и спортивно-оздоровительной работы
- Учебно-оздоровительная база «Локомотив»
- Спортивно-оздоровительный комплекс в с. Андреевка
- База для проведения практических занятий по геологии и геодезии в с. Петропавловка
- Администрация
- Общежитие №2
- Общежитие №3
- Общежитие №4/1
- Общежитие №4/2
- Общежитие №5
- Общежитие №6/1
- Общежитие №6/2
- Общежитие №1 ХТЖТ
- Общежитие №2 ХТЖТ
Управление аспирантуры, докторантуры и подготовки научных кадров
- Отдел организационно-технической работы
Координационный центр научной подготовки студентов
- Организационно-технический отдел
Редакция журнала «Социальные и гуманитарные науки на Дальнем Востоке»
Редакция журнала «Транспорт Азиатско-Тихоокеанского региона»
Отдел мобилизационной подготовки (второй отдел)
Служба охраны
Управление штаба по делам гражданской обороны и чрезвычайным ситуациям
- Отдел эксплуатации средств связи и сигнализации
Центр практического обучения и взаимодействия с производством
- Хозяйственный отдел
- Отдел главного механика
- Отдел главного энергетика
- Отдел материально-технического снабжения
- Отдел по содержанию зданий и сооружений
- Отдел технического контроля
Управление научно-исследовательских работ
- Организационно-технический отдел
Научно-образовательный центр «Содействие развитию современных искусств и дизайна»
Инновационный центр
- Молодежный студенческий бизнес-инкубатор
Учебно-научно-производственное объединение
Научно-исследовательские лаборатории
- Изысканий
- Гидравлика
- Основания и фундаменты
- Современных транспортных технологий и систем имени профессора, д.т.н. Виктора Григорьевича Григоренко
Научно-инженерные центры
- Энергоаудит
- Испытательная лаборатория «ДВ-Материал»
- Испытательный центр строительных материалов, изделий и конструкций «ДВГУПС-Стройтест»
Общественные организации
- Профком студентов
- Профком сотрудников